Regionální členění Českého florbalu je uspořádáno do sedmi tzv. partnerských krajů, které jsou složeny vždy z dvojice sousedních vyšších samosprávných celků ustanovených dle zákona o krajích č. 129/2000 Sb. Každý florbalový region je řízen svým výkonným výborem a odbornými komisemi, které volí regionální valné hromady, jež zároveň vysílají delegáty na celostátní valnou hromadu. V čele florbalových krajů stojí hejtmané.